Congress detail

Authors: Pistilli, A.D.; Pratta, G.R.; Angelone, L.; Arce, D.P.

Title: Diseño de una arquitectura en pipeline para la descarga y dnálisis de decuencias de promotores en Solanum lycopersicum.

Resumen: Se presenta el desarrollo de una arquitectura en pipeline que automatiza la descarga de promotores de Solanum lycopersicum desde la Sol Genomics Network y luego los analiza con los programas MEME y TOMTOM. El código está disponible en www.github.com/lalebot/pip-prom-tom y utiliza Git como software de control de versiones. Se combina el uso de threads en Python, expresiones regulares y base de datos SQLite para que conjuntamente disminuyan el tiempo de descarga de los promotores y optimicen la utilizaci´on de recursos inform´aticos. La metodología que presenta este trabajo es potencialmente aplicable a otras áreas biológicas.

Meeting type: Congreso.

Type of job: Artículo Completo.

Production: Diseño de una arquitectura en pipeline para la descarga y dnálisis de decuencias de promotores en Solanum lycopersicum.

Scientific meeting: SABI 2017, XXI Congreso Argentino de Bioingeniería y X Jornadas de Ingeniería Clínica.

Meeting place: Córdoba.

Organizing Institution: Sociedad Argentina de Bioingeniería.

It's published?: Yes

Publication place: Córdoba

Meeting month: 10

Year: 2017.